Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYCP3Q8IZU3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYCP3Q8IZU3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SYCP3Q8IZU3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP3Q8IZU3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms