Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL3Q8IVW4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms