Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF550Q7Z398 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF550Q7Z398 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF550Q7Z398 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF550Q7Z398 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF550Q7Z398 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF550Q7Z398 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF550Q7Z398 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF550Q7Z398 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF550Q7Z398 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF550Q7Z398 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF550Q7Z398 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF550Q7Z398 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF550Q7Z398 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF550Q7Z398 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF550Q7Z398 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF550Q7Z398 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF550Q7Z398 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF550Q7Z398 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF550Q7Z398 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF550Q7Z398 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF550Q7Z398 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF550Q7Z398 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF550Q7Z398 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF550Q7Z398 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF550Q7Z398 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF550Q7Z398 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF550Q7Z398 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms