Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APTXQ7Z2E3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms