Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms