Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMBR1LQ6UX01 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms