Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW49

SPESP1, Sperm equatorial segment protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPESP1Q6UW49 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SPESP1Q6UW49 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPESP1Q6UW49 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms