Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms