Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms