Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms