Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE6

LCN10, Epididymal-specific lipocalin-10, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN10Q6JVE6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms