Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms