Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD1Q5VV17 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms