Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms