Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D1BQ5T0F9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms