Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPAT3Q53EU6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms