Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms