Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7I2

CNPY1, Protein canopy homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY1Q3B7I2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNPY1Q3B7I2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms