Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TWISTNBQ3B726 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms