Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC96Q2M329 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC96Q2M329 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC96Q2M329 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC96Q2M329 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC96Q2M329 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC96Q2M329 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC96Q2M329 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC96Q2M329 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC96Q2M329 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC96Q2M329 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC96Q2M329 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC96Q2M329 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC96Q2M329 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC96Q2M329 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC96Q2M329 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC96Q2M329 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC96Q2M329 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC96Q2M329 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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CCDC96Q2M329 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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CCDC96Q2M329 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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