Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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