Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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