Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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