Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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