Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms