Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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