Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms