Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SF1Q15637 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SF1Q15637 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SF1Q15637 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SF1Q15637 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SF1Q15637 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SF1Q15637 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SF1Q15637 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SF1Q15637 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SF1Q15637 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SF1Q15637 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SF1Q15637 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SF1Q15637 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SF1Q15637 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SF1Q15637 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SF1Q15637 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SF1Q15637 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SF1Q15637 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SF1Q15637 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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