Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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RABEP1Q15276 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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RABEP1Q15276 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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RABEP1Q15276 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RABEP1Q15276 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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RABEP1Q15276 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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RABEP1Q15276 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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RABEP1Q15276 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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