Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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NECTIN1Q15223 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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