Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EEA1Q15075 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EEA1Q15075 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EEA1Q15075 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EEA1Q15075 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EEA1Q15075 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EEA1Q15075 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
EEA1Q15075 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
EEA1Q15075 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
EEA1Q15075 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
EEA1Q15075 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
EEA1Q15075 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
EEA1Q15075 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
EEA1Q15075 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
EEA1Q15075 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
EEA1Q15075 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
EEA1Q15075 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
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