Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
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CHD4Q14839 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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CHD4Q14839 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
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CHD4Q14839 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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CHD4Q14839 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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CHD4Q14839 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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CHD4Q14839 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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CHD4Q14839 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
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CHD4Q14839 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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