Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSPNQ14714 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms