Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RRP1BQ14684 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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