Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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