Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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COL9A3Q14050 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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COL9A3Q14050 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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COL9A3Q14050 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
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