Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBFBQ13951 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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