Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCINQ13939 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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CCINQ13939 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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CCINQ13939 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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