Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTB1Q13884 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms