Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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