Protein–RNA interactions for Protein: Q13233

MAP3K1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K1Q13233 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MAP3K1Q13233 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP3K1Q13233 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP3K1Q13233 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP3K1Q13233 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP3K1Q13233 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP3K1Q13233 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP3K1Q13233 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP3K1Q13233 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP3K1Q13233 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K1Q13233 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K1Q13233 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K1Q13233 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K1Q13233 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K1Q13233 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K1Q13233 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K1Q13233 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K1Q13233 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K1Q13233 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K1Q13233 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K1Q13233 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K1Q13233 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K1Q13233 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K1Q13233 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K1Q13233 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K1Q13233 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K1Q13233 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K1Q13233 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K1Q13233 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms