Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms