Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
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