Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms