Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TROQ12816 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TROQ12816 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TROQ12816 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TROQ12816 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TROQ12816 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TROQ12816 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TROQ12816 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TROQ12816 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TROQ12816 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TROQ12816 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TROQ12816 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TROQ12816 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TROQ12816 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TROQ12816 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TROQ12816 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TROQ12816 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TROQ12816 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TROQ12816 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TROQ12816 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TROQ12816 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TROQ12816 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TROQ12816 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TROQ12816 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TROQ12816 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TROQ12816 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TROQ12816 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TROQ12816 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TROQ12816 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TROQ12816 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TROQ12816 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TROQ12816 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TROQ12816 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TROQ12816 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TROQ12816 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TROQ12816 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TROQ12816 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TROQ12816 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TROQ12816 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TROQ12816 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TROQ12816 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TROQ12816 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TROQ12816 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TROQ12816 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TROQ12816 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TROQ12816 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TROQ12816 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TROQ12816 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TROQ12816 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TROQ12816 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TROQ12816 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TROQ12816 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TROQ12816 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TROQ12816 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TROQ12816 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TROQ12816 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TROQ12816 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TROQ12816 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TROQ12816 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TROQ12816 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TROQ12816 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TROQ12816 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TROQ12816 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TROQ12816 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TROQ12816 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TROQ12816 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TROQ12816 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TROQ12816 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TROQ12816 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TROQ12816 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TROQ12816 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TROQ12816 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TROQ12816 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TROQ12816 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TROQ12816 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TROQ12816 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TROQ12816 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TROQ12816 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TROQ12816 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TROQ12816 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TROQ12816 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TROQ12816 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TROQ12816 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TROQ12816 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TROQ12816 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TROQ12816 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TROQ12816 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TROQ12816 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TROQ12816 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TROQ12816 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TROQ12816 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TROQ12816 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TROQ12816 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TROQ12816 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TROQ12816 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TROQ12816 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TROQ12816 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TROQ12816 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TROQ12816 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TROQ12816 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
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