Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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FOXO1Q12778 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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FOXO1Q12778 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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FOXO1Q12778 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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