Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
AP1B1Q10567 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
AP1B1Q10567 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP1B1Q10567 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP1B1Q10567 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP1B1Q10567 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP1B1Q10567 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP1B1Q10567 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP1B1Q10567 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP1B1Q10567 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
AP1B1Q10567 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
AP1B1Q10567 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP1B1Q10567 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP1B1Q10567 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP1B1Q10567 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP1B1Q10567 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP1B1Q10567 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP1B1Q10567 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP1B1Q10567 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP1B1Q10567 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP1B1Q10567 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP1B1Q10567 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP1B1Q10567 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP1B1Q10567 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP1B1Q10567 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP1B1Q10567 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP1B1Q10567 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP1B1Q10567 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP1B1Q10567 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP1B1Q10567 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP1B1Q10567 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP1B1Q10567 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP1B1Q10567 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP1B1Q10567 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP1B1Q10567 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP1B1Q10567 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP1B1Q10567 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms