Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms