Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLFN5Q08AF3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms