Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSME1Q06323 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms